Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCATO75600 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GCATO75600 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCATO75600 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCATO75600 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCATO75600 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCATO75600 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCATO75600 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCATO75600 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCATO75600 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GCATO75600 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCATO75600 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCATO75600 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCATO75600 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
GCATO75600 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCATO75600 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCATO75600 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GCATO75600 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCATO75600 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCATO75600 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCATO75600 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCATO75600 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCATO75600 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCATO75600 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCATO75600 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCATO75600 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCATO75600 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCATO75600 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GCATO75600 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCATO75600 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCATO75600 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GCATO75600 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCATO75600 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCATO75600 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCATO75600 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCATO75600 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCATO75600 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCATO75600 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCATO75600 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCATO75600 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GCATO75600 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GCATO75600 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCATO75600 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCATO75600 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCATO75600 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCATO75600 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCATO75600 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCATO75600 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCATO75600 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCATO75600 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCATO75600 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCATO75600 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCATO75600 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCATO75600 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCATO75600 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCATO75600 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCATO75600 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GCATO75600 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GCATO75600 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCATO75600 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCATO75600 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCATO75600 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCATO75600 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCATO75600 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCATO75600 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GCATO75600 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GCATO75600 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCATO75600 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCATO75600 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCATO75600 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCATO75600 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCATO75600 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCATO75600 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCATO75600 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GCATO75600 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCATO75600 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCATO75600 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GCATO75600 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCATO75600 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCATO75600 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCATO75600 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCATO75600 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCATO75600 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCATO75600 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCATO75600 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCATO75600 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCATO75600 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCATO75600 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCATO75600 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCATO75600 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GCATO75600 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCATO75600 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GCATO75600 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCATO75600 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCATO75600 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCATO75600 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCATO75600 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCATO75600 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCATO75600 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCATO75600 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms