Protein–RNA interactions for Protein: O75385

ULK1, Serine/threonine-protein kinase ULK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK1O75385 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ULK1O75385 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ULK1O75385 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ULK1O75385 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ULK1O75385 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ULK1O75385 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ULK1O75385 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ULK1O75385 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ULK1O75385 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ULK1O75385 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ULK1O75385 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ULK1O75385 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ULK1O75385 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ULK1O75385 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ULK1O75385 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ULK1O75385 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ULK1O75385 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ULK1O75385 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ULK1O75385 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ULK1O75385 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ULK1O75385 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ULK1O75385 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ULK1O75385 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ULK1O75385 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ULK1O75385 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ULK1O75385 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ULK1O75385 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ULK1O75385 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ULK1O75385 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ULK1O75385 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ULK1O75385 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ULK1O75385 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ULK1O75385 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ULK1O75385 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ULK1O75385 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ULK1O75385 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ULK1O75385 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ULK1O75385 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ULK1O75385 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ULK1O75385 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ULK1O75385 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ULK1O75385 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ULK1O75385 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ULK1O75385 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ULK1O75385 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ULK1O75385 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ULK1O75385 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ULK1O75385 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ULK1O75385 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ULK1O75385 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ULK1O75385 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ULK1O75385 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ULK1O75385 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ULK1O75385 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ULK1O75385 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ULK1O75385 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ULK1O75385 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ULK1O75385 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK1O75385 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK1O75385 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK1O75385 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK1O75385 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK1O75385 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK1O75385 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK1O75385 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK1O75385 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK1O75385 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK1O75385 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK1O75385 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ULK1O75385 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ULK1O75385 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ULK1O75385 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ULK1O75385 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ULK1O75385 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ULK1O75385 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ULK1O75385 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ULK1O75385 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ULK1O75385 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ULK1O75385 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ULK1O75385 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ULK1O75385 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ULK1O75385 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ULK1O75385 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ULK1O75385 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ULK1O75385 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ULK1O75385 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ULK1O75385 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ULK1O75385 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ULK1O75385 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ULK1O75385 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ULK1O75385 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ULK1O75385 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ULK1O75385 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ULK1O75385 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ULK1O75385 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ULK1O75385 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ULK1O75385 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ULK1O75385 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ULK1O75385 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ULK1O75385 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms