Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TSPAN6O43657 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TSPAN6O43657 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSPAN6O43657 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms