Protein–RNA interactions for Protein: O43639

NCK2, Cytoplasmic protein NCK2, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK2O43639 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCK2O43639 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCK2O43639 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCK2O43639 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCK2O43639 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCK2O43639 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCK2O43639 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCK2O43639 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCK2O43639 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NCK2O43639 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCK2O43639 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NCK2O43639 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NCK2O43639 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NCK2O43639 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NCK2O43639 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NCK2O43639 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NCK2O43639 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCK2O43639 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCK2O43639 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCK2O43639 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NCK2O43639 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCK2O43639 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NCK2O43639 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCK2O43639 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCK2O43639 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCK2O43639 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCK2O43639 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCK2O43639 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCK2O43639 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCK2O43639 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCK2O43639 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCK2O43639 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCK2O43639 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCK2O43639 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCK2O43639 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCK2O43639 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NCK2O43639 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCK2O43639 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCK2O43639 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCK2O43639 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCK2O43639 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCK2O43639 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCK2O43639 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCK2O43639 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCK2O43639 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCK2O43639 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCK2O43639 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCK2O43639 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCK2O43639 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCK2O43639 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NCK2O43639 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCK2O43639 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCK2O43639 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCK2O43639 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCK2O43639 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCK2O43639 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCK2O43639 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCK2O43639 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCK2O43639 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCK2O43639 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCK2O43639 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NCK2O43639 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NCK2O43639 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCK2O43639 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCK2O43639 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCK2O43639 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCK2O43639 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCK2O43639 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCK2O43639 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NCK2O43639 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCK2O43639 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCK2O43639 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCK2O43639 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCK2O43639 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCK2O43639 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCK2O43639 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCK2O43639 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCK2O43639 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCK2O43639 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCK2O43639 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCK2O43639 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCK2O43639 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCK2O43639 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCK2O43639 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCK2O43639 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCK2O43639 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCK2O43639 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCK2O43639 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCK2O43639 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCK2O43639 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCK2O43639 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCK2O43639 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCK2O43639 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCK2O43639 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCK2O43639 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NCK2O43639 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCK2O43639 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCK2O43639 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCK2O43639 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCK2O43639 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms