Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPAA1O43292 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPAA1O43292 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPAA1O43292 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPAA1O43292 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPAA1O43292 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPAA1O43292 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPAA1O43292 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPAA1O43292 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPAA1O43292 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GPAA1O43292 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GPAA1O43292 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GPAA1O43292 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPAA1O43292 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms