Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 SSX2IP-206ENST00000476905 2272 ntTSL 28.45□□□□□ -1.065e-8■■■■■ 27
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PRPF4O43172 SLC46A1-201ENST00000578217 596 ntTSL 47.43□□□□□ -1.225e-8■■■■■ 27
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PRPF4O43172 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.277e-13■■■■■ 27
PRPF4O43172 ABL2-202ENST00000367623 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.357e-13■■■■■ 27
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PRPF4O43172 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.563e-6■■■■■ 27
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PRPF4O43172 MST1-209ENST00000484269 1518 ntTSL 517.47■□□□□ 0.399e-9■■■■■ 27
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PRPF4O43172 WDR6-220ENST00000608424 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.614e-7■■■■■ 26.8
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PRPF4O43172 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.567e-20■■■■■ 26.8
PRPF4O43172 PUS1-204ENST00000456665 577 ntTSL 523.07■■□□□ 1.289e-7■■■■■ 26.8
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PRPF4O43172 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.049e-7■■■■■ 26.8
PRPF4O43172 STK25-208ENST00000423004 773 ntTSL 214.67□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 26.8
PRPF4O43172 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.121e-7■■■■■ 26.8
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PRPF4O43172 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 26.8
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