Protein–RNA interactions for Protein: O15514

POLR2D, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2DO15514 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
POLR2DO15514 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLR2DO15514 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR2DO15514 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms