Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDC80O14777 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NDC80O14777 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NDC80O14777 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDC80O14777 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDC80O14777 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDC80O14777 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDC80O14777 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDC80O14777 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDC80O14777 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NDC80O14777 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDC80O14777 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDC80O14777 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDC80O14777 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NDC80O14777 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDC80O14777 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDC80O14777 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDC80O14777 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NDC80O14777 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDC80O14777 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDC80O14777 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDC80O14777 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDC80O14777 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDC80O14777 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDC80O14777 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDC80O14777 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDC80O14777 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDC80O14777 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDC80O14777 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDC80O14777 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDC80O14777 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDC80O14777 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDC80O14777 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDC80O14777 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDC80O14777 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDC80O14777 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDC80O14777 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDC80O14777 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDC80O14777 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDC80O14777 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDC80O14777 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDC80O14777 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDC80O14777 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDC80O14777 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDC80O14777 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDC80O14777 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDC80O14777 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDC80O14777 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDC80O14777 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDC80O14777 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDC80O14777 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDC80O14777 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDC80O14777 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDC80O14777 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDC80O14777 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDC80O14777 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDC80O14777 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDC80O14777 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDC80O14777 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDC80O14777 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDC80O14777 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDC80O14777 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDC80O14777 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDC80O14777 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDC80O14777 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDC80O14777 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDC80O14777 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NDC80O14777 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDC80O14777 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NDC80O14777 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDC80O14777 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDC80O14777 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDC80O14777 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDC80O14777 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDC80O14777 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NDC80O14777 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDC80O14777 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDC80O14777 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDC80O14777 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDC80O14777 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDC80O14777 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDC80O14777 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDC80O14777 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDC80O14777 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDC80O14777 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDC80O14777 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDC80O14777 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDC80O14777 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NDC80O14777 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDC80O14777 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDC80O14777 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDC80O14777 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDC80O14777 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDC80O14777 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDC80O14777 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDC80O14777 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDC80O14777 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NDC80O14777 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDC80O14777 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDC80O14777 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms