Protein–RNA interactions for Protein: O14598

VCY, Testis-specific basic protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCYO14598 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VCYO14598 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
VCYO14598 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VCYO14598 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VCYO14598 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VCYO14598 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VCYO14598 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VCYO14598 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VCYO14598 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VCYO14598 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VCYO14598 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VCYO14598 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VCYO14598 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VCYO14598 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VCYO14598 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VCYO14598 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VCYO14598 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
VCYO14598 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VCYO14598 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VCYO14598 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VCYO14598 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VCYO14598 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VCYO14598 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VCYO14598 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VCYO14598 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VCYO14598 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VCYO14598 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VCYO14598 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VCYO14598 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VCYO14598 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
VCYO14598 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VCYO14598 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VCYO14598 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VCYO14598 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VCYO14598 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VCYO14598 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VCYO14598 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
VCYO14598 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VCYO14598 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VCYO14598 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VCYO14598 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VCYO14598 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VCYO14598 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VCYO14598 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VCYO14598 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VCYO14598 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VCYO14598 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VCYO14598 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VCYO14598 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VCYO14598 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VCYO14598 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VCYO14598 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VCYO14598 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VCYO14598 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VCYO14598 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VCYO14598 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VCYO14598 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VCYO14598 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VCYO14598 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VCYO14598 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VCYO14598 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VCYO14598 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VCYO14598 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VCYO14598 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VCYO14598 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VCYO14598 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VCYO14598 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VCYO14598 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VCYO14598 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VCYO14598 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VCYO14598 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VCYO14598 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VCYO14598 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VCYO14598 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VCYO14598 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VCYO14598 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VCYO14598 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VCYO14598 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VCYO14598 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VCYO14598 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VCYO14598 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VCYO14598 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VCYO14598 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VCYO14598 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VCYO14598 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VCYO14598 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VCYO14598 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VCYO14598 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VCYO14598 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VCYO14598 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VCYO14598 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VCYO14598 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VCYO14598 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VCYO14598 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VCYO14598 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VCYO14598 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VCYO14598 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VCYO14598 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VCYO14598 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VCYO14598 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms