Protein–RNA interactions for Protein: O14561

NDUFAB1, Acyl carrier protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAB1O14561 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFAB1O14561 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFAB1O14561 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFAB1O14561 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFAB1O14561 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFAB1O14561 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFAB1O14561 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFAB1O14561 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFAB1O14561 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFAB1O14561 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFAB1O14561 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFAB1O14561 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFAB1O14561 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFAB1O14561 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFAB1O14561 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFAB1O14561 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFAB1O14561 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFAB1O14561 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFAB1O14561 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFAB1O14561 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFAB1O14561 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFAB1O14561 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFAB1O14561 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFAB1O14561 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFAB1O14561 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NDUFAB1O14561 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFAB1O14561 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFAB1O14561 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFAB1O14561 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFAB1O14561 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFAB1O14561 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFAB1O14561 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFAB1O14561 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFAB1O14561 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFAB1O14561 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFAB1O14561 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFAB1O14561 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFAB1O14561 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFAB1O14561 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFAB1O14561 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFAB1O14561 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms