Protein–RNA interactions for Protein: O00762

UBE2C, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CO00762 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE2CO00762 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2CO00762 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms