Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QQQ9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QQQ9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QQQ9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QQQ9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QQQ9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QQQ9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QQQ9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QQQ9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QQQ9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QQQ9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QQQ9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QQQ9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3QQQ9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3QQQ9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3QQQ9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3QQQ9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3QQQ9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3QQQ9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3QQQ9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3QQQ9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3QQQ9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3QQQ9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
J3QQQ9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3QQQ9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3QQQ9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3QQQ9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3QQQ9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3QQQ9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
J3QQQ9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3QQQ9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3QQQ9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3QQQ9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3QQQ9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3QQQ9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3QQQ9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3QQQ9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3QQQ9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3QQQ9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3QQQ9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3QQQ9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3QQQ9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3QQQ9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3QQQ9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3QQQ9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3QQQ9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3QQQ9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
J3QQQ9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3QQQ9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3QQQ9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3QQQ9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3QQQ9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3QQQ9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3QQQ9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3QQQ9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3QQQ9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3QQQ9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3QQQ9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3QQQ9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3QQQ9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3QQQ9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3QQQ9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
J3QQQ9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
J3QQQ9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
J3QQQ9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3QQQ9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3QQQ9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3QQQ9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3QQQ9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3QQQ9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3QQQ9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3QQQ9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3QQQ9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3QQQ9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3QQQ9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
J3QQQ9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3QQQ9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
J3QQQ9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3QQQ9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3QQQ9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3QQQ9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3QQQ9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3QQQ9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
J3QQQ9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QQQ9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QQQ9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QQQ9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QQQ9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QQQ9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QQQ9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QQQ9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QQQ9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QQQ9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QQQ9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QQQ9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QQQ9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QQQ9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
J3QQQ9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
J3QQQ9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
J3QQQ9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms