Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ERVV-2B6SEH9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
ERVV-2B6SEH9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ERVV-2B6SEH9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms