Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PALM2-AKAP2B1ALY0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PALM2-AKAP2B1ALY0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms