Protein–RNA interactions for Protein: A6NCL1

GMNC, Geminin coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMNCA6NCL1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GMNCA6NCL1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GMNCA6NCL1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GMNCA6NCL1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms