Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LAMB4A4D0S4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
LAMB4A4D0S4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LAMB4A4D0S4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms