Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWV2

TRBV4-1, T-cell receptor beta variable 4-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TRBV4-1A0A0J9YWV2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TRBV4-1A0A0J9YWV2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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TRBV4-1A0A0J9YWV2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRBV4-1A0A0J9YWV2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRBV4-1A0A0J9YWV2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TRBV4-1A0A0J9YWV2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
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