Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
AFG3L2Q9Y4W6 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms