Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NEU3Q9UQ49 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NEU3Q9UQ49 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms