Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMG5Q9UPR3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms