Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTF2Q9UNY4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTF2Q9UNY4 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms