Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTRF1LQ9UGC7 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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