Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CGGBP1Q9UFW8 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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