Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TFIP11Q9UBB9 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms