Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRBP1Q9P2E9 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms