Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE2

CISH, Cytokine-inducible SH2-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CISHQ9NSE2 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CISHQ9NSE2 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms