Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
CTNNBIP1Q9NSA3 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms