Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 PTPN20CP-201ENST00000614090 920 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C11orf49Q9H6J7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms