Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FOXQ1Q9C009 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
FOXQ1Q9C009 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms