Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ROPN1BQ9BZX4 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms