Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 RTL10-202ENST00000405640 6785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
SMIM3Q9BZL3 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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