Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TRIM55Q9BYV6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms