Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GORASP1Q9BQQ3 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GORASP1Q9BQQ3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GORASP1Q9BQQ3 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GORASP1Q9BQQ3 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GORASP1Q9BQQ3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GORASP1Q9BQQ3 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GORASP1Q9BQQ3 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GORASP1Q9BQQ3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GORASP1Q9BQQ3 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GORASP1Q9BQQ3 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GORASP1Q9BQQ3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GORASP1Q9BQQ3 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GORASP1Q9BQQ3 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GORASP1Q9BQQ3 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GORASP1Q9BQQ3 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms