Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HIC2Q96JB3 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms