Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SGF29Q96ES7 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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