Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ECHDC3Q96DC8 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ECHDC3Q96DC8 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
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