Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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SPTSSAQ969W0 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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SPTSSAQ969W0 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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SPTSSAQ969W0 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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SPTSSAQ969W0 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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SPTSSAQ969W0 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTSSAQ969W0 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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