Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TOPBP1Q92547 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms