Protein–RNA interactions for Protein: Q92537

SUSD6, Sushi domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD6Q92537 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SUSD6Q92537 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms