Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CTTNBP2Q8WZ74 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTTNBP2Q8WZ74 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms