Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWW8

GAB3, GRB2-associated-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAB3Q8WWW8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GAB3Q8WWW8 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GAB3Q8WWW8 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GAB3Q8WWW8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GAB3Q8WWW8 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms