Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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ZNF548Q8NEK5 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ZNF548Q8NEK5 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ZNF548Q8NEK5 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ZNF548Q8NEK5 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ZNF548Q8NEK5 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ZNF548Q8NEK5 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ZNF548Q8NEK5 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ZNF548Q8NEK5 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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ZNF548Q8NEK5 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ZNF548Q8NEK5 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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ZNF548Q8NEK5 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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ZNF548Q8NEK5 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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ZNF548Q8NEK5 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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ZNF548Q8NEK5 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ZNF548Q8NEK5 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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