Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PLD3Q8IV08 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PLD3Q8IV08 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms