Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APTXQ7Z2E3 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms