Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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ATG16L1Q676U5 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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ATG16L1Q676U5 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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ATG16L1Q676U5 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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ATG16L1Q676U5 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ATG16L1Q676U5 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ATG16L1Q676U5 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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