Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HP1BP3Q5SSJ5 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms