Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF169-204ENST00000481550 1696 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CEACAM20-201ENST00000611497 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC010970.1-201ENST00000445125 1848 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DDX39B-214ENST00000458640 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02362-203ENST00000617323 2044 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MBP-207ENST00000397865 2127 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GPATCH2L-209ENST00000556663 2112 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CAT-201ENST00000241052 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AP002754.1-201ENST00000506329 2349 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ALDH8A1-203ENST00000367845 2383 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RFX5-215ENST00000452671 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC010969.1-201ENST00000340444 2412 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CARS-201ENST00000278224 2491 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SCNN1B-202ENST00000343070 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CASP7-201ENST00000345633 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FAM156B-203ENST00000593751 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FAM156A-201ENST00000596733 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 JMJD7-PLA2G4B-201ENST00000342159 2966 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RUFY4-202ENST00000374155 2977 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CTCFL-204ENST00000422869 2966 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DNAH2-202ENST00000570791 2994 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 TP53AIP1-206ENST00000602346 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SLC25A25-205ENST00000432073 3678 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 CACNB1-202ENST00000394303 3742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KRTAP21-1Q3LI58 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms