Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTPRNQ16849 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 381.5 ms