Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

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Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 PRR23A-201ENST00000383163 801 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 GLT8D2-204ENST00000547583 862 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LAMA3Q16787 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 THYN1-203ENST00000392594 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LAMA3Q16787 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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