Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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PCSK7Q16549 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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PCSK7Q16549 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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PCSK7Q16549 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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PCSK7Q16549 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PCSK7Q16549 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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